La historia de Trigun se centra en Vash, quien se encuentra enfrentado a su hermano Knives, un asesino líder de un grupo de criminales. Todo ocurre en el planeta Gunsmoke, lugar donde las naves arcas de la humanidad aterrizaron tras un accidente. Allí la atmósfera se asemeja al Lejano Oeste.

Tanto Vash como Knives no son humanos, pero esto no es del conocimiento público. Ellos son seres que surgieron de una Planta, tal como llaman a los misteriosos seres que proveen de energía al pueblo.

En el 2010, Madhouse lanzó la película de este anime, llamada Trigun: Badlands Rumble. En esta nueva historia, Vash se enfrenta Nicolas D. Wolfwood, su gran aliado.

Oliver Atom (Tsubasa Ozora) sueña nada más con el fútbol. Su mayor anhelo es que Japón gane su primer Mundial, y desde niño prueba sus habilidades en el juego enfrentándose a grandes jugadores. Benji Price (Genzo Wakabayashi) y Steve Hyuga (Kojiro Hyuga) son algunos de los poderosos adversarios que enfrentarán y con quienes se unirá para ganar el campeonato del mundo.

Capitán Tsubasa - Road to 2002 fue producido por Madhouse como parte de la campaña mundialista de Japón, teniendo en cuenta que el país junto a Corea del Sur serian sede del Mundial. Se trata de un reboot que incluye episodios que no formaron parte de las series animadas anteriores. Como las anteriores versiones, el recibimiento de parte del público fue grande. El 3D formó parte de la nueva serie.

Takeo Gouda es un estudiante que se destaca por su amabilidad y su llamativo aspecto físico, es demasiado corpulento y alto. Debido a estas características no es popular entre las mujeres. De hecho, la chica de sus sueños se solo tiene ojos para su amigo, Makoto Sunakawa. Takeo siente que no tiene suerte para el amor hasta que en su vida se cruza Rinko Yamato.

Como verán, Ore Monogatari!! no es el típico Shoujo; el protagonista principal es Takeo, quien tampoco cabe dentro del cuadro de galán. No obstante, esta comedia de Madhouse supo atrapar a la audiencia por ser una historia de amor muy peculiar.

Gran parte de la humanidad ha caído víctima de un virus mortal; hay pocos sobrevivientes. Entre los que se salvaron se encuentra Takashi Komuro y sus compañeros de clase, quienes deberán hacerle frente a varias adversidades, como el hecho de que los muertos se han convertido en zombies y que otros humanos trataran de aniquilarlos.

Rei Miyamoto, Saeko Busujima y Saya Takagi, entre otros, son parte del grupo de lidera Takashi. Todos intentarán reunirse con su familia y encontrar un lugar seguro para vivir. Si es posible algo así en un mundo colmado por una plaga de zombies.

A diferencia del manga que fue cancelado, el anime de Highschool of the Dead tuvo un buen recibimiento por parte del público internacional. Tanto así que, en 2011, Madhouse realizó un Ova de la serie titulado Drifters of the Dead. Se especula que Madhouse se encuentra trabajando en una segunda temporada de la serie, aunque ésta no presenta fecha de estreno por el momento.

Atsuko Chiba es una psiquiatra que experimenta con un nuevo método terapéutico. Gracias a una tecnología llamada MiniDC puede entrar en los sueños de sus pacientes mediante su alter ego llamada Paprika. Pero cuando roban los prototipos experimentales, ella tendrá que detener a los culpables en el mundo onírico.

Bajo la dirección de Satoshi Kon, Paprika fue estrenada en el Festival de Cine de Venecia, siendo nominada al León de Oro. Esta historia de ciencia ficción realizada por Madhouse consiguió la aprobación del público y de la crítica especializada. Un año después de su estreno formó parte del Festival de Annecy, en la sección largometrajes.

Por venganza, Clare se convierte en una claymore, una guerrera cazadora de monstruos devoradores de hombres llamados Yomas. El objetivo que persigue Clare es Priscilla, la claymore que terminó con la vida de su madre adoptiva, Teresa. Es por eso que se enfrentará a todo, superando sus límites, para enfrentarse a la número uno.

Durante 24 capítulos Madhouse fue fiel al manga escrito por Norihiro Yagi, por lo que estos episodios contaron con el mismo recibimiento positivo con que contó la historia gráfica. Los últimos dos fueron creados especialmente para el anime. El éxito de Claymore se vio reflejado en los fans de la serie, quienes tras la finalización de anime iniciaron recolectan firmas para que haya una segunda temporada.

Gon Freecs descubre que su padre -al que había creído muerto- se ha convertido en un importante cazador de fama mundial. Por esta revelación, el joven decide seguir los pasos de su padre y abandona la Isla Ballena donde creció. Se inscribe para realizar el examen de cazador y allí hará varios amigos que serán parte de todas sus aventuras.

Primeramente, Hunter x Hunter fue producido por el estudio Nippon Animation, alcanzando un importante reconocimiento por parte de los televidentes. Diez años después, Madhouse se encargó de relanzar el anime, adaptando la serie a la historia del manga e incorporando episodios que no fueron parte de la primera serie.

El nuevo comienzo de las aventuras de Gon también alcanzó el éxito. Tanto así que Madhouse produjo dos películas de la serie: Phantom Rouge, estrenada en el 2013, y The Last Mission, que salió a la luz el mismo año.

Tras un accidente, Makoto Konno descubre que puede regresar en el tiempo. Es así como la joven estudiante de secundaria decide hacer uso de su poder para su propio beneficio, generando malestar entre sus compañeros de escuela. Y cuando todo parecía encaminarse, descubre que no es la única; Chiaki Mamiya es otro viajero.

Toki wo Kakeru Shoujo no es solo una historia de ciencia ficción, hay romance en este anime. Chiaki está enamorado de Makoto, quien no tarda en despertar el mismo sentir hacia su compañero de clases. Sin embargo, existe un problema: él proviene de un futuro lejano y los viajes en el tiempo son limitados.

Esta película producida por Madhouse fue distinguida en el Festival de Sitges como la “Mejor película de animación” y recibió una distinción especial en el Festival de Annecy. Además cosechó buenas críticas por parte de la prensa mundial.

Saitama, cansado de fracasar en las entrevistas laborales, un día decide hacer realidad su sueño de niño: ser un superhéroe. Sin armas especiales ni inteligencia sobre la media, optó por entrenarse para poder convertirse en el héroe que tanto soñó. Luego de tres años, comienza sus aventuras heroicas en compañía de su discípulo, Genos.

One Punch Man es una parodia del género de los superhéroes, ya que el protagonista está lejos de encajar con el estereotipo de héroe. No goza de popularidad (es rechazado por la sociedad), es completamente calvo y sus gestos delatan su poca inteligencia. Pero, aunque pocos lo sepan, Saitama es el hombre más fuerte del planeta.

Chikashi Kubota fue el encargado de diseñar a los personajes para la adaptación que realizó Madhouse del manga de Young Jump. La musicalización del Opening de la serie fue realizada por JAM Project, la misma banda que se encargó de Dragon Ball Z.

Light Yagami es el estudiante estrella; cuenta con gran popularidad en su escuela por su inteligencia y físico. Sin embargo, se siente insatisfecho por cómo la justicia opera en este mundo. Pronto su malestar encuentra un remedio: un cuaderno shinigami (Dios de la muerte) que le permite castigar a los criminales con solo apuntar sus nombres.

Por su misterioso accionar contra el crimen, Light es apodado Kira y genera temor en el mundo. Esto hace que L, el mejor detective del planeta, tome cartas en el asunto. Tanto L como Kira tienen su propia concepción de lo que es la Justicia, e inician una guerra para imponerla.

En esta producción, Madhouse ha hecho una adaptación fiel al manga publicado por Shōnen Jump. El misterio y el suspenso colorean cada secuencia de Death Note y es reforzado por la banda sonora del anime, que corrió por cuenta de Yoshihisa Hirano y Hideki Taniuchi.

El éxito de Death Note generó tres películas Live Actions. También se especuló que saldría otra adaptación cinematográfica, esta vez generada por un estudio de Hollywood.