En Bullet Armors, el mundo ha sido gobernado por los Tremors, máquinas con voluntad propia que buscan el exterminio de la raza humana y que encontraron la manera de evolucionar. En este mundo existen dos facciones humanas: los Criadores, aquellos que poseen los Beacon y son capaces de utilizar las máquinas a voluntad, y los Bakers, quienes son las facciones de humanos que se dedican a cazar a los Tremor.

En este manga seguimos la historia de Ion Oobusanz, un chico que vive con su hermana. Él es un entusiasta y amante de las máquinas que encuentra un Beacon, el cual es un dispositivo capaz de controlar a las máquinas. El siempre ha querido ser un Criador y ahora con el dispositivo le será posible comenzar a controlar a las máquinas, embarcándose en la búsqueda de su padre quien lo abandonó a él y su familia años atrás, en un mundo dominado por las máquinas.

La humanidad ha desarrollado a los Clockworker, los cuales se pueden describir como hombres mecánicos que se solían utilizar como armas durante la guerra debido a su resistencia y capacidad de ataque. Aún después que terminó la contienda, estos robots siguieron rondando por el mundo, causando destrucción, provocando muertes y sembrando el terror a donde quiera que van.

Machina es una chica arrogante y muy segura de sus habilidades asesinas, la cual en muchas ocasiones actúa por instinto; Deus, por otro lado, es su Clockworker, un poco más reservado y que suele ver las cosas de una manera más lógica. Ambos viajarán por el país, cazando y asesinando a los robots junto con los humanos que los controlan, en un ambiente típicamente Western.

En el futuro, el planeta se convirtió casi en su totalidad en un desierto donde solo unos pocos humanos y androides sobrevivieron, pero se enfrentan a la extinción. Sajoukai es una ciudad ubicada en medio del desierto, en allí se encuentra una caja misteriosa que no puede ser abierta más que por miembros de una familia que la ha heredado por generaciones. Esto fue así hasta que el último heredero desapareció, y ahora no existe nadie en el mundo que pueda revelar el contenido de esta.

Rindt Kobayaki es un humano que siempre ha vivido en esta ciudad y el cual no está consciente que es el heredero de la llave de la caja, hasta que se encuentra con Handred, una androide muy carismática que trabaja como guardaespaldas a sueldo. Después de esta revelación, todos los cazarrecompensas de la ciudad iran tras Rindt, desde un niño que maneja un mecha gigante hasta personas con armaduras que necesitarán sortear los peligros y cuidar al protagonista.

Hace algunos centenares de años, las fuerzas del planeta lucharon contra los invasores alienígenas, pero a pesar de los esfuerzos de los humanos, perdieron la guerra y los alienígenas controlan gran parte de la galaxia. Más allá de los resultados de esa contienda, los humanos viven… aunque bajo la administración del imperio alienígena y de manera muy aburrida: sin problemas, sin ambiciones.

Shinobu Hazuki, es un chico criado por un robot que ahora vive tranquilamente; su mejor amigo, Satou, cree que los alienígenas manipulan a los humanos y quiere luchar contra el poder, sin embargo, nadie lo toma en cuenta. Eso hasta que encuentra un mecha y, por accidente, Shinobu lo activa, volviéndose un objetivo del imperio. Increíblemente, y con ayuda de una chica, viajará a través de la galaxia para buscar su perdón.

A finales del siglo XXII, en la Tierra ya no existían los suficientes recursos para la supervivencia de la humanidad. Nuestro mundo ya no bastaba y la humanidad se enfocó en el descubrimiento de un nuevo planeta habitable, y así fue como se encontró la Second Earth, el doceavo planeta del sistema solar, terraformado posteriormente por una empresa privada llamada W.S.

La empresa W.S. también se encargó de construir los Buster Dress, unos robots pilotados, con inteligencia artificial y utilizados como naves de combate. Después de un ataque terrorista cerca del planeta, se desplegaron las fuerzas de los Buster Dress; Haruto Aoi es enviado junto con su robot, Gunhawk, y el resto de la división militar para investigar este misterio. Sin embargo, al momento de desembarcar en el planeta, todos serán atacados por la fuerzas terroristas...

El Re-verse es un mundo donde viven seres salidos de la mitología griega. El Paus Centegarden ha creado a los Gigas y se han dado a la tarea de invadir la áreas vecinas utilizando estos robots, siendo en total 12 Gigas basados en el horóscopo chino, los cuales pueden ser destruidos atacando su núcleo. Pero pronto encontrarán resistencia entre las áreas vecinas del Live-Earth, entre quienes se encuentran arpías y minotauros.

En este manga el protagonista es Touga Eita, un joven con entrenamiento ninja que prefiere pasar la vida jugando videojuegos y evitando entrenar, ya que no quiere ser el heredero del dojo de su abuelo. Un día en su desocupada vida, Touga salvó a Aero —una arpía proveniente del Re-verse— de un Gigas, y al salvarla se le considera un héroe. Con tal hazaña, el chico será llevado a esta tierra para ayudar en el combate contra los Gigas que buscan quedarse con todo el continente.

En un lugar en donde no se puede extraer petróleo de la tierra, la humanidad se vio en la necesidad de encontrar otra fuente de energía, y así fue como las personas se dieron cuenta que el continente de Cruzón era fuente de los cuarzos. La humanidad sintetizó estos cuarzos logrando obtener energía, pudiendo poner en marcha engranes, armas, autos y todo tipo de maquinaria… pero sobre todo los Golems, robots pilotados utilizados como armas de guerra.

Hay una guerra entre el reino de Krisna regido por Hodr y la mancomunidad de Athens, en donde Zess es el comandante del escuadrón Valkiria. Rygart Arrow es una de las pocas personas que no puede utilizar los cuarzos; siempre segregado debido a su condición, no puede utilizar armas, autos o Golems… aunque es el mejor amigo de los representantes de ambas facciones en guerra. En este contexto, Rygart se verá envuelto en medio de la guerra entre Golems, haciendo el rol de mediador entre las partes militares.

El IS, más que un mecha es un tipo de exoesqueleto, el cual se creó con la finalidad de operar en el espacio. Después de que la exploración espacial fracasara, se utilizaron de manera multifuncional, sobre todo en el ámbito deportivo, ya que está prohibido su uso militar y solo las mujeres son capaces de activar los Infinite Stratos. Con base en esto se fundó la IS Academy, una institución la cual da alojo a estudiantes de todo el mundo, que enseña cómo manejar las armaduras.

Ichika Orimura es el único hombre en el planeta capaz de pilotear un IS, y por consiguiente es uno de los alumnos de la academia. Al no poder utilizar los Infinite Stratos como armas militares, dentro de la academia se desarrollan torneos de combate entre los usuarios de las armaduras... y esto también creó cierta rivalidad entre los países, ya que cada uno de los usuarios tiene un modelo característico de IS. De esta manera, en este manga vemos batallas espectaculares, pero en forma de competencia deportiva.

Los Object se desarrollaron con un objetivo militar, y ningún arma conocida por el humano puede contenerlos. Después de un despliegue militar y la caída de las naciones del mundo en manos de estos robots de guerra, ni siquiera el arsenal nuclear los puede destruir, y solo se pueden hacer daño entre los propios Object; esto lleva a las guerras limpias, que no son más que duelos entre Objects, en un formato de batallas cortas que reduce las bajas civiles.

Los Élites son los responsables de pilotar estas máquinas, y Qwenthur es un ingeniero militar que es enviado a la base en Alaska para estudiar a los Objects. Aquí conoce a Milinda, la piloto del Baby Magnum, quien después de ser salvada por Qwenthur le ofrece su ayuda en todo lo posible, siempre y cuando sean misiones que no impliquen utilizar el Object.

Keiji Moriya vive en un bucle: cada vez que es asesinado en el campo de batalla, vuelve a despertar al inicio del día en su cama. La ventaja de este fenómeno es que recuerda todas las experiencias vividas antes de morir, y de esta manera puede actuar con cautela y adelantarse a los sucesos que están por ocurrir. Esto sin duda le da mucha ventaja en el campo de batalla, volviéndose uno de los mejores soldados del batallón.

Los Mimics son seres de origen desconocido los cuales solo tienen un objetivo: exterminar a la raza humana. Para esto se ha desarrollado un tipo de robot-armadura armado, con el que es posible abatir a los Mimics... pero a pesar de la dureza y la pesadez de las armaduras, a los seres hostiles les resulta fácil traspasar las armaduras, volviéndose ellos mismo una amenaza muy peligrosa.